全自动无人采样船用来监测以前难以到达的区域。过去人工划船到水域采样，现在可以使用无人船完成准确定l点采水样。比起人工监测，无人船监测更能节省监测成本，提高监测效率，并可以到达存在潜在危险的水域，如污染区和深水区等。
应急监测无人船的船体小巧便携兼具自动采样与自动监测功能，推进器涵道式设计有效防止水草、渔网缠绕，具备机动灵活地实现大范围水体的水样自动采集与实时监测功能。可广泛应用于环保、水文、水利、水务、科研、渔政等领域。
但和陆地不同的是，测绘无人船，在海域遇到的困难和阻力明显更大，无人船的发展也稍显滞后。商用无人船在科研调查、环境保护和货运方面有着广泛的应用，其中科研调查和环境保护正在处于普及阶段，国内外有诸多无人船企业参与其中，推出了不同种类的无人船。而备受瞩目的货运无人船，还有诸多问题亟待解决，如果货运无人船能够被广泛应用，那么无人船也就迎来了“高光时刻”。
当前，我国大部分城市内河受到城市发展的制约，不能充分满足人工监测和采样的条件，导致水体监测点位和覆盖率不足，监测数据不能客观地反映监测区域的水质污染情况，而且城市内河、工业河、取水口、河流支流、污染源等水质监测涉及周边环境的限制，可利用空间小，给项目实施带来诸多不便。针对这一现象，以无人船、水下机器人等为载体，搭载先进的全自动水质分析设备，对流域水质进行实时在线监测，实现了各种水质指标如总磷、总氮、水下机器人等实时在线监测。
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